La orden jesuita fue la última orden religiosa en llegar al virreinato del Perú en el siglo XVI. Poco a poco, incrementó su cantidad de adherentes, por lo que se hizo necesaria la construcción de un lugar adecuado para poder formar a los miembros de la orden. Así, en el año 1605, gracias a la donación del señor Antonio Correa Ureña, se inician las primeras obras de construcción del lugar que luego recibiría el nombre de Casa de Probación y Noviciado de San Antonio Abad. En este lugar, los jesuitas recibían y educaban a los aspirantes a la Compañía de Jesús. El recinto, actualmente conocido como casona de San Marcos, acogió a los jesuitas hasta 1767.