Tras una profunda rehabilitación, se abrió al público de nuevo en 2009. En octubre de 2011 recibió los fondos del Museo Nacional de Reproducciones Artísticas, cerrado al público desde 2002, y que, desde noviembre de 2011, se exhibirán en el nuevo conjunto arquitectónico del museo, el formado por la iglesia de San Benito el Viejo y la Casa del Sol. En paralelo se ha aprobado que el museo recobre el nombre anterior de Museo Nacional de Escultura.
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